123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1988 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1300 aa  2508    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  33.55 
 
 		 1304 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1284 aa  292  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1307 aa  291  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1309 aa  283  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1288 aa  274  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1261 aa  262  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1341 aa  259  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1273 aa  254  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1273 aa  249  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1264 aa  248  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1283 aa  240  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 1346 aa  234  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1141 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1269 aa  228  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1301 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1265 aa  221  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1286 aa  219  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25 
 
 		 1274 aa  216  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1266 aa  214  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1267 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  25.39 
 
 		 1273 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.88 
 
 		 1301 aa  205  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1271 aa  201  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1276 aa  201  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1271 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1271 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1306 aa  199  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.41 
 
 		 1426 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1419 aa  197  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1287 aa  197  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1273 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1271 aa  195  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1276 aa  193  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1392 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23 
 
 		 1307 aa  190  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1305 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1275 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1284 aa  189  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1394 aa  188  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  22.31 
 
 		 1331 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1265 aa  187  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1277 aa  187  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1307 aa  187  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1426 aa  186  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1276 aa  184  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1266 aa  183  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1266 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1266 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1266 aa  182  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1266 aa  182  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1384 aa  182  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  26.27 
 
 		 1450 aa  181  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1419 aa  181  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1291 aa  178  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1426 aa  177  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.12 
 
 		 1323 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1379 aa  177  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1381 aa  176  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1398 aa  175  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1291 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1277 aa  174  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1419 aa  174  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1266 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1436 aa  170  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1266 aa  168  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1399 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.03 
 
 		 1379 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.35 
 
 		 1266 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1266 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  25.35 
 
 		 1472 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1399 aa  165  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.33 
 
 		 1384 aa  164  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1397 aa  162  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  26 
 
 		 1397 aa  161  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1419 aa  161  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1399 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1368 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1378 aa  159  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1398 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1397 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1397 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1397 aa  159  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1372 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1399 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1397 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1399 aa  158  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1420 aa  157  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1398 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1290 aa  157  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  20.45 
 
 		 1294 aa  157  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1425 aa  157  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1430 aa  155  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1441 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1428 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1153 aa  137  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1153 aa  137  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  19.9 
 
 		 1380 aa  125  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1443 aa  124  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.45 
 
 		 1224 aa  121  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>