121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3520 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1381 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1441 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1425 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1379 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1420 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 1472 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1394 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1384 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1378 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  100 
 
 		 1450 aa  2763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1398 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1426 aa  457  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  28.21 
 
 		 1426 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1426 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1418 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1419 aa  417  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1399 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1307 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1284 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1399 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1399 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1399 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1399 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1398 aa  396  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1398 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1397 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1397 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1397 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1397 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1372 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1368 aa  387  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1261 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1397 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1428 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1341 aa  377  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1430 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1397 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1264 aa  323  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.48 
 
 		 1384 aa  281  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.03 
 
 		 1379 aa  270  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1309 aa  229  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 1304 aa  227  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1269 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1273 aa  214  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1271 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1271 aa  211  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1273 aa  210  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1273 aa  205  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1267 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1271 aa  198  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  26.61 
 
 		 1300 aa  192  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1277 aa  183  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1265 aa  179  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1271 aa  178  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1276 aa  178  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  24.45 
 
 		 1273 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1275 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1276 aa  173  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1265 aa  170  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.87 
 
 		 1346 aa  170  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.86 
 
 		 1301 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1141 aa  169  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1419 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1287 aa  167  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1301 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1276 aa  162  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1277 aa  160  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1288 aa  160  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1266 aa  160  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1286 aa  160  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1274 aa  155  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1266 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1266 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1266 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1266 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1266 aa  155  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1306 aa  153  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1290 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1443 aa  145  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.82 
 
 		 1323 aa  143  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1291 aa  144  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1266 aa  141  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1390 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 		 1266 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1266 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1266 aa  139  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.49 
 
 		 1266 aa  139  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1266 aa  139  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1266 aa  138  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1439 aa  138  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1419 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1266 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1266 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1436 aa  126  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1284 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  20.04 
 
 		 1294 aa  122  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1383 aa  122  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1459 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1416 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>