128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5159 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  53.02 
 
 		 1381 aa  1408    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  50.1 
 
 		 1441 aa  1324    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  53.19 
 
 		 1425 aa  1339    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  51.58 
 
 		 1379 aa  1345    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  50.05 
 
 		 1418 aa  904    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  49.93 
 
 		 1420 aa  1248    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  44.29 
 
 		 1472 aa  960    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  52.45 
 
 		 1378 aa  1330    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  46.7 
 
 		 1384 aa  1145    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  34.81 
 
 		 1450 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  100 
 
 		 1394 aa  2747    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1398 aa  632  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1426 aa  632  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  33.29 
 
 		 1426 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1419 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1426 aa  612  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1307 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1430 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1341 aa  532  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1419 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1428 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1284 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1399 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1399 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1399 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1399 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1399 aa  489  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1397 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1397 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1398 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1397 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1397 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1397 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1372 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1398 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  30.98 
 
 		 1368 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1264 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1261 aa  426  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.99 
 
 		 1384 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.83 
 
 		 1379 aa  347  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1271 aa  249  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1271 aa  234  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1269 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1271 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1273 aa  228  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1266 aa  226  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  26.29 
 
 		 1304 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1271 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1307 aa  215  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1291 aa  214  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1305 aa  212  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1307 aa  212  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1267 aa  211  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1419 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.01 
 
 		 1301 aa  209  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1287 aa  208  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1265 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1436 aa  198  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1266 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1266 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1266 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1266 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1291 aa  196  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1266 aa  196  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1283 aa  194  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1277 aa  193  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1276 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.77 
 
 		 1300 aa  189  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.4 
 
 		 1266 aa  188  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1266 aa  188  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1301 aa  188  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1276 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1266 aa  186  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1266 aa  186  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1266 aa  185  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1284 aa  184  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1266 aa  184  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 1266 aa  184  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1265 aa  183  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1266 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1288 aa  181  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  20.61 
 
 		 1392 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1417 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21 
 
 		 1323 aa  173  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1416 aa  173  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1306 aa  173  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1417 aa  172  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1273 aa  170  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1390 aa  169  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1273 aa  167  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1277 aa  166  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1446 aa  165  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1274 aa  165  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1454 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1383 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1441 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1459 aa  162  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1286 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>