124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002388 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  48.63 
 
 		 1287 aa  1252    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  61.4 
 
 		 1291 aa  1641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  85.18 
 
 		 1266 aa  2248    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  100 
 
 		 1301 aa  2666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1276 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1276 aa  559  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1291 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1305 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1307 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1307 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1277 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1284 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1266 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1266 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1266 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1266 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1266 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1266 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  27.48 
 
 		 1266 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1266 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1266 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 1266 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1266 aa  502  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1266 aa  502  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1266 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1266 aa  499  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1439 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1265 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1383 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1301 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1419 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  27 
 
 		 1390 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1392 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1416 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1436 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1417 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.77 
 
 		 1294 aa  436  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1443 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  25.17 
 
 		 1323 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1454 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1446 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1459 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1441 aa  420  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  24.81 
 
 		 1331 aa  416  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1419 aa  370  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  28.36 
 
 		 1515 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.86 
 
 		 1304 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1265 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1277 aa  227  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  20.85 
 
 		 1273 aa  224  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1267 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1284 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1290 aa  220  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1271 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1273 aa  217  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  19.58 
 
 		 1271 aa  218  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1271 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1271 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  20.32 
 
 		 1269 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1261 aa  207  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  20.32 
 
 		 1276 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1341 aa  205  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.88 
 
 		 1300 aa  204  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1309 aa  204  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1394 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  19.97 
 
 		 1275 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1381 aa  202  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.27 
 
 		 1273 aa  200  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1425 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20 
 
 		 1273 aa  197  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1307 aa  197  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1398 aa  196  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  24.08 
 
 		 1472 aa  195  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1384 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1379 aa  186  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1426 aa  183  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.78 
 
 		 1426 aa  182  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1378 aa  181  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  23.52 
 
 		 1283 aa  180  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1283 aa  180  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1426 aa  179  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1420 aa  175  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  19.79 
 
 		 1272 aa  172  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.24 
 
 		 1288 aa  171  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1419 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.62 
 
 		 1380 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1430 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.42 
 
 		 1384 aa  166  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1441 aa  163  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1264 aa  160  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1397 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1397 aa  159  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1397 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1397 aa  155  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  20.06 
 
 		 1428 aa  155  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1368 aa  155  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1372 aa  155  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  22.4 
 
 		 1450 aa  155  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1397 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>