124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1735 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1346 aa  2707    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1443 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1383 aa  238  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  27.37 
 
 		 1300 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1264 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1288 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1416 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1392 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1390 aa  230  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1441 aa  229  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1417 aa  228  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1454 aa  227  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1419 aa  226  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1459 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1446 aa  224  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1283 aa  224  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1436 aa  223  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1417 aa  221  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1439 aa  221  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1284 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.8 
 
 		 1304 aa  210  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1384 aa  207  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1273 aa  202  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1307 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1273 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1261 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  25 
 
 		 1276 aa  196  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1305 aa  196  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1284 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1276 aa  196  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1307 aa  195  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1307 aa  194  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1291 aa  193  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1266 aa  184  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.68 
 
 		 1266 aa  184  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1287 aa  184  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1266 aa  184  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1266 aa  183  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1277 aa  181  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1266 aa  181  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1266 aa  181  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1266 aa  180  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 		 1266 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1341 aa  177  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1381 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1266 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1265 aa  174  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1419 aa  174  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1291 aa  171  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1286 aa  171  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1306 aa  171  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1266 aa  171  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1274 aa  169  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1301 aa  164  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1379 aa  164  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 1450 aa  161  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1398 aa  160  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1309 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1399 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1277 aa  157  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1265 aa  153  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1398 aa  151  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.1 
 
 		 1301 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1267 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1398 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1419 aa  149  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.62 
 
 		 1273 aa  149  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1399 aa  148  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 1472 aa  147  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1420 aa  146  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1378 aa  147  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1399 aa  141  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1399 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1399 aa  141  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.5 
 
 		 1426 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1425 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1153 aa  138  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1153 aa  137  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24 
 
 		 1397 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  23.09 
 
 		 1515 aa  135  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1397 aa  134  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1368 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1426 aa  131  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1397 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1372 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1397 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1397 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1141 aa  129  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  19.8 
 
 		 1379 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1271 aa  129  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1441 aa  129  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1430 aa  129  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  20.1 
 
 		 1384 aa  128  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1426 aa  127  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>