130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1057 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1307 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  100 
 
 		 1264 aa  2564    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1284 aa  711    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1341 aa  596  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1261 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1379 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  28.58 
 
 		 1425 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1381 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1378 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1441 aa  439  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1394 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1426 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  27.25 
 
 		 1426 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1420 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1419 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1384 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1399 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1399 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1426 aa  405  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1430 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1398 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1428 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1399 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1399 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1398 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1397 aa  383  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1398 aa  383  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  26.38 
 
 		 1472 aa  379  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1397 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1368 aa  373  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1397 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1397 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1397 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1397 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1372 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  25.3 
 
 		 1450 aa  323  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.39 
 
 		 1384 aa  322  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1273 aa  309  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1288 aa  308  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1273 aa  306  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.57 
 
 		 1379 aa  293  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1418 aa  271  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.32 
 
 		 1304 aa  264  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.78 
 
 		 1300 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1309 aa  247  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1265 aa  243  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.72 
 
 		 1346 aa  239  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1267 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1269 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1271 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1271 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1277 aa  210  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1441 aa  205  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1275 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1286 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1273 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1383 aa  202  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1283 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1274 aa  202  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1276 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1459 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1271 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1454 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1271 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.12 
 
 		 1273 aa  195  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1446 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1301 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  20.81 
 
 		 1392 aa  190  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1443 aa  189  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1419 aa  189  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1416 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1436 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1417 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1306 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1417 aa  176  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  20.81 
 
 		 1291 aa  174  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1287 aa  174  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  19.52 
 
 		 1323 aa  173  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1390 aa  171  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1141 aa  171  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1277 aa  170  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  19.9 
 
 		 1301 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1291 aa  163  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1266 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.17 
 
 		 1266 aa  162  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1266 aa  162  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.31 
 
 		 1266 aa  162  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1266 aa  162  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1266 aa  161  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1266 aa  161  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1266 aa  160  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1276 aa  159  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1266 aa  159  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1276 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1266 aa  155  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1266 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1266 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1266 aa  148  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>