130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1776 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1384 aa  2800    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  63.82 
 
 		 1379 aa  1816    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  27.15 
 
 		 1426 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1426 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1426 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1430 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1419 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1428 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1397 aa  432  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1419 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1398 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1397 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1397 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1397 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1397 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1372 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1368 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1399 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1398 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1399 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1399 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1399 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1399 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1420 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1307 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1378 aa  370  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1384 aa  370  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1425 aa  356  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1394 aa  350  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1381 aa  344  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1379 aa  329  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  24.53 
 
 		 1472 aa  328  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1341 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1264 aa  312  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1441 aa  308  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1261 aa  292  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1284 aa  290  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  21.2 
 
 		 1450 aa  273  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1418 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1273 aa  202  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1273 aa  201  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1291 aa  189  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.76 
 
 		 1266 aa  173  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1288 aa  173  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1305 aa  173  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1266 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1266 aa  172  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1266 aa  171  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.4 
 
 		 1266 aa  171  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1266 aa  171  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1266 aa  171  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1307 aa  171  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1276 aa  170  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1276 aa  171  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1266 aa  170  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1266 aa  169  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1307 aa  169  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1291 aa  167  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1265 aa  166  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.42 
 
 		 1301 aa  166  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.92 
 
 		 1304 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  21.33 
 
 		 1300 aa  164  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1283 aa  155  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1277 aa  151  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  20.15 
 
 		 1309 aa  147  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1287 aa  145  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1392 aa  142  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1284 aa  140  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1266 aa  138  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1301 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.37 
 
 		 1331 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1266 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1266 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1266 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1266 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1390 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1265 aa  129  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1153 aa  128  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1153 aa  128  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1419 aa  128  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  20.03 
 
 		 1346 aa  126  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1276 aa  126  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.18 
 
 		 1273 aa  125  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  19.48 
 
 		 1271 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  20.48 
 
 		 1436 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1275 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  19.85 
 
 		 1271 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1417 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  19.78 
 
 		 1273 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1417 aa  119  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.23 
 
 		 1267 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1416 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.26 
 
 		 1272 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  21.88 
 
 		 1224 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  19.77 
 
 		 1271 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1419 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>