127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0461 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  99.53 
 
 
1266 aa  2558    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  99.21 
 
 
1266 aa  2550    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  99.53 
 
 
1266 aa  2558    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  81.14 
 
 
1266 aa  2141    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  49.45 
 
 
1277 aa  1259    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  50.47 
 
 
1284 aa  1304    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  54.48 
 
 
1276 aa  1425    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  53.78 
 
 
1276 aa  1406    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  75.43 
 
 
1265 aa  2017    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  49.85 
 
 
1305 aa  1293    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  99.84 
 
 
1266 aa  2565    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  98.97 
 
 
1266 aa  2543    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  55.1 
 
 
1291 aa  1453    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  49.58 
 
 
1307 aa  1293    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  49.62 
 
 
1307 aa  1293    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  100 
 
 
1266 aa  2569    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  98.66 
 
 
1266 aa  2536    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2137    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  99.29 
 
 
1266 aa  2555    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  98.97 
 
 
1266 aa  2538    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  27.48 
 
 
1301 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  27.54 
 
 
1266 aa  496  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  26.21 
 
 
1287 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  26.87 
 
 
1291 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.22 
 
 
1301 aa  432  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.94 
 
 
1436 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.26 
 
 
1443 aa  383  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.24 
 
 
1323 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.77 
 
 
1392 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.98 
 
 
1390 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.06 
 
 
1439 aa  364  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  23.71 
 
 
1417 aa  360  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  23.89 
 
 
1419 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  23.66 
 
 
1383 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.6 
 
 
1416 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24.21 
 
 
1417 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.35 
 
 
1294 aa  346  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  24.65 
 
 
1331 aa  342  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  23.19 
 
 
1446 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  23.42 
 
 
1459 aa  330  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  23.34 
 
 
1454 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  23.42 
 
 
1441 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  27.21 
 
 
1515 aa  279  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.92 
 
 
1284 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.98 
 
 
1307 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.88 
 
 
1309 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.1 
 
 
1273 aa  240  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.17 
 
 
1273 aa  236  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.41 
 
 
1304 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.7 
 
 
1265 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  24.14 
 
 
1426 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25.64 
 
 
1419 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.64 
 
 
1271 aa  212  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.74 
 
 
1426 aa  210  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.08 
 
 
1283 aa  206  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  24.28 
 
 
1426 aa  204  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.13 
 
 
1379 aa  201  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.8 
 
 
1261 aa  201  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.88 
 
 
1381 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.43 
 
 
1271 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.48 
 
 
1288 aa  197  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.96 
 
 
1420 aa  196  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  22.31 
 
 
1277 aa  195  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  21.98 
 
 
1275 aa  193  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  24.08 
 
 
1290 aa  191  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.47 
 
 
1271 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.21 
 
 
1269 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.85 
 
 
1267 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.4 
 
 
1276 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.59 
 
 
1419 aa  183  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.51 
 
 
1273 aa  183  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.46 
 
 
1394 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.09 
 
 
1271 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.25 
 
 
1346 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.93 
 
 
1273 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.58 
 
 
1272 aa  170  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.35 
 
 
1384 aa  170  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.31 
 
 
1384 aa  169  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.65 
 
 
1300 aa  169  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.55 
 
 
1380 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.61 
 
 
1398 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.81 
 
 
1141 aa  159  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.15 
 
 
1264 aa  156  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  22.46 
 
 
1419 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.91 
 
 
1399 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.91 
 
 
1399 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.17 
 
 
1286 aa  149  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.09 
 
 
1398 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.79 
 
 
1399 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25.06 
 
 
1399 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  24.97 
 
 
1398 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.32 
 
 
1274 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.41 
 
 
1283 aa  142  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  23.44 
 
 
1397 aa  140  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  24.85 
 
 
1399 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.92 
 
 
1153 aa  135  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.92 
 
 
1153 aa  135  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>