124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01889 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  53.57 
 
 		 1286 aa  1262    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1274 aa  1259    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  100 
 
 		 1306 aa  2551    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  56.19 
 
 		 1283 aa  1345    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1284 aa  291  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.25 
 
 		 1304 aa  288  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1309 aa  283  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1307 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1288 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1273 aa  274  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1273 aa  270  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1261 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1307 aa  251  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1307 aa  249  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1269 aa  247  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1305 aa  246  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 1300 aa  241  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1141 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1277 aa  234  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1291 aa  231  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1271 aa  229  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1273 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1271 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1276 aa  221  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1266 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1384 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  26.67 
 
 		 1331 aa  216  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1443 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 		 1266 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1284 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1276 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1266 aa  214  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1264 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.19 
 
 		 1346 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1266 aa  208  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1266 aa  206  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1266 aa  206  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  21.78 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1265 aa  204  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1271 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.61 
 
 		 1301 aa  196  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1416 aa  194  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1267 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1301 aa  194  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1341 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  20.6 
 
 		 1323 aa  188  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1394 aa  187  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1419 aa  185  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1459 aa  185  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.82 
 
 		 1273 aa  184  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1441 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1454 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1417 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1383 aa  183  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1436 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1417 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1276 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1446 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1398 aa  179  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1381 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1398 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1265 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1399 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1399 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1399 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1399 aa  169  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1277 aa  168  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1439 aa  167  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.31 
 
 		 1283 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1271 aa  164  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1399 aa  162  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.58 
 
 		 1224 aa  159  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1379 aa  159  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1426 aa  158  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1153 aa  157  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1153 aa  157  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1275 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1210 aa  155  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1291 aa  154  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.63 
 
 		 1380 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1397 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1397 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.38 
 
 		 1287 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 1426 aa  149  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1430 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  21.26 
 
 		 1272 aa  149  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1397 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1397 aa  145  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1426 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1368 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1419 aa  144  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1397 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>