134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0549 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  99.92 
 
 		 1224 aa  2355    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 1210 aa  2385    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1288 aa  183  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1284 aa  164  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1261 aa  152  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.83 
 
 		 1304 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1291 aa  142  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1283 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1309 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1306 aa  135  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1439 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1436 aa  131  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1266 aa  131  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.69 
 
 		 1266 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1266 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1291 aa  129  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1266 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1266 aa  126  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  126  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1274 aa  126  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1266 aa  125  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1266 aa  125  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  125  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.74 
 
 		 1323 aa  125  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1266 aa  125  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1392 aa  124  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1286 aa  124  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1265 aa  124  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1284 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1266 aa  122  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1271 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1277 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1276 aa  119  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1276 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  19.85 
 
 		 1301 aa  115  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1419 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1269 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1265 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.72 
 
 		 1273 aa  112  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1399 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1398 aa  109  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  19.33 
 
 		 1287 aa  109  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.78 
 
 		 1384 aa  109  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23 
 
 		 1399 aa  108  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1271 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.05 
 
 		 1300 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1267 aa  105  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  21.35 
 
 		 1346 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1398 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1399 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1398 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  20.05 
 
 		 1416 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1397 aa  101  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1399 aa  101  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.38 
 
 		 1331 aa  101  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1399 aa  101  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  20.1 
 
 		 1390 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1271 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1397 aa  99  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1397 aa  98.6  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1372 aa  98.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1368 aa  98.2  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1397 aa  98.2  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1397 aa  98.2  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1271 aa  98.2  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  19.4 
 
 		 1273 aa  97.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1419 aa  97.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  19.53 
 
 		 1307 aa  96.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1397 aa  96.3  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.02 
 
 		 1379 aa  96.3  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1276 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1379 aa  95.5  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  19.02 
 
 		 1273 aa  95.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1273 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1275 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  19.85 
 
 		 1283 aa  90.9  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1264 aa  90.9  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1277 aa  89.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1420 aa  87.4  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1153 aa  85.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1430 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1419 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1153 aa  84.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1428 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1419 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1341 aa  75.5  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1443 aa  75.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  27.17 
 
 		 1061 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1417 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  19 
 
 		 1426 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  28.1 
 
 		 1515 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  19.11 
 
 		 1426 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1305 aa  71.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1454 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1459 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1446 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>