194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0899 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  45.23 
 
 		 1080 aa  928    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  100 
 
 		 1061 aa  2152    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  44.48 
 
 		 1079 aa  912    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  37.54 
 
 		 1094 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  93.31 
 
 		 1061 aa  2012    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  50.81 
 
 		 1104 aa  1070    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  40.36 
 
 		 1070 aa  763    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1102 aa  227  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  30.25 
 
 		 1234 aa  101  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.22 
 
 		 632 aa  91.7  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  29.38 
 
 		 1144 aa  88.6  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  26.4 
 
 		 1224 aa  81.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1210 aa  74.7  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  22.96 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  25.26 
 
 		 656 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  28.75 
 
 		 921 aa  66.6  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1398 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1397 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1398 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1399 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1399 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1399 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1399 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1399 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  27.75 
 
 		 791 aa  65.1  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1368 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1397 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  22.91 
 
 		 669 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1397 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1397 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1397 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1372 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  26.42 
 
 		 740 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1397 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  32.35 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  27.74 
 
 		 856 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  25.39 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  27.74 
 
 		 843 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.22 
 
 		 1323 aa  59.7  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  25.39 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  26.63 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  27.74 
 
 		 843 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1394 aa  58.9  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  25.81 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  23.7 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  25 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  22.19 
 
 		 745 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1384 aa  57.4  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  24.26 
 
 		 943 aa  57.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  30.58 
 
 		 696 aa  57.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  22.19 
 
 		 739 aa  57.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1088 aa  57.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  21.48 
 
 		 669 aa  57.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.16 
 
 		 782 aa  56.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1264 aa  56.2  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1283 aa  56.2  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  21.59 
 
 		 640 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.66 
 
 		 732 aa  55.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  23.2 
 
 		 686 aa  55.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  30 
 
 		 797 aa  54.7  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  26.18 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  23.94 
 
 		 688 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1419 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  24.34 
 
 		 678 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  21.92 
 
 		 729 aa  54.3  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.95 
 
 		 1384 aa  54.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  21.08 
 
 		 742 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  25 
 
 		 1428 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  25.41 
 
 		 856 aa  53.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  23.08 
 
 		 810 aa  53.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  30 
 
 		 853 aa  53.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  29.66 
 
 		 506 aa  53.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1430 aa  53.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  18.88 
 
 		 699 aa  52.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  29.19 
 
 		 812 aa  52.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1040 aa  52  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.86 
 
 		 709 aa  52  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1197 aa  51.6  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  25 
 
 		 664 aa  51.6  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  25.13 
 
 		 669 aa  51.6  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1420 aa  52  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  23.81 
 
 		 688 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  21.58 
 
 		 1210 aa  51.6  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  23.81 
 
 		 688 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  33.33 
 
 		 893 aa  50.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1277 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.23 
 
 		 794 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  24.08 
 
 		 670 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  21.13 
 
 		 691 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1210 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  22.68 
 
 		 691 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1284 aa  50.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  21.13 
 
 		 691 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1398 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  23.16 
 
 		 765 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1286 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  21.13 
 
 		 686 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  21.13 
 
 		 686 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>