42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0181 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  100 
 
 
943 aa  1889    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  23.63 
 
 
995 aa  181  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  23.32 
 
 
996 aa  177  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  30.98 
 
 
1040 aa  170  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  32.26 
 
 
1088 aa  127  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  28.69 
 
 
1169 aa  108  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  21.46 
 
 
1151 aa  100  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  21.82 
 
 
1162 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  28.37 
 
 
1141 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  21.73 
 
 
1149 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  20.95 
 
 
1175 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  27.05 
 
 
1192 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  22.98 
 
 
1093 aa  86.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  28.17 
 
 
1197 aa  83.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.86 
 
 
1102 aa  82.8  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  27.81 
 
 
1097 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  25.17 
 
 
1024 aa  80.9  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  25.2 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  25.2 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  26.44 
 
 
1177 aa  77.8  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  25.78 
 
 
1240 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  22.75 
 
 
1255 aa  75.1  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  20.86 
 
 
1243 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  20.61 
 
 
1232 aa  73.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  26.32 
 
 
1132 aa  73.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  21.77 
 
 
1240 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  23.14 
 
 
1237 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  21.81 
 
 
1111 aa  72  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  19.31 
 
 
1210 aa  71.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  21.91 
 
 
1244 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  19.91 
 
 
1141 aa  69.7  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  24.48 
 
 
1146 aa  68.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  24.48 
 
 
1146 aa  68.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  26.36 
 
 
1132 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  25.45 
 
 
1133 aa  64.3  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  25.45 
 
 
1155 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  21.75 
 
 
1149 aa  62  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  24.55 
 
 
1128 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  21.48 
 
 
1105 aa  59.3  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  24.26 
 
 
1061 aa  57.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.74 
 
 
1061 aa  55.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  22.22 
 
 
1080 aa  49.3  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>