189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2265 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1615    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  31.93 
 
 
742 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.41 
 
 
797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  39.02 
 
 
712 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  29.75 
 
 
794 aa  321  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  29.93 
 
 
893 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.52 
 
 
732 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  35.9 
 
 
699 aa  303  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.4 
 
 
789 aa  260  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  26.29 
 
 
741 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  26.25 
 
 
747 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.15 
 
 
745 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  26.25 
 
 
740 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  26.47 
 
 
741 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  26.5 
 
 
748 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  25.63 
 
 
741 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  26.87 
 
 
748 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  33.85 
 
 
695 aa  210  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  30.26 
 
 
703 aa  209  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  24.3 
 
 
719 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  26.65 
 
 
748 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  32.77 
 
 
695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  27.27 
 
 
748 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  25 
 
 
750 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  30.16 
 
 
682 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  25.53 
 
 
741 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  33.09 
 
 
606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  35.79 
 
 
608 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  34.04 
 
 
606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  33.77 
 
 
606 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  33.77 
 
 
606 aa  180  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.74 
 
 
725 aa  177  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  21.72 
 
 
762 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  34.45 
 
 
607 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  33.89 
 
 
607 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  33.89 
 
 
607 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.85 
 
 
750 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  33.68 
 
 
614 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  30.97 
 
 
606 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  34.11 
 
 
607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  32.39 
 
 
611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  32.26 
 
 
604 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  28 
 
 
696 aa  163  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  30.22 
 
 
606 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  31.46 
 
 
612 aa  161  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.32 
 
 
701 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  29.68 
 
 
711 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  31.19 
 
 
677 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  28.12 
 
 
614 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  29.97 
 
 
502 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  31.23 
 
 
640 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  29.63 
 
 
508 aa  143  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.25 
 
 
709 aa  138  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  30.47 
 
 
826 aa  121  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  27.95 
 
 
649 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  26.91 
 
 
640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  25 
 
 
611 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  25.16 
 
 
705 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.24 
 
 
1013 aa  101  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  26.84 
 
 
602 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  28.71 
 
 
655 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.84 
 
 
675 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  22.8 
 
 
1095 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.78 
 
 
617 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.78 
 
 
617 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  27.36 
 
 
649 aa  94.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  23.51 
 
 
617 aa  94.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  23.59 
 
 
1217 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.51 
 
 
617 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.42 
 
 
660 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.51 
 
 
617 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.51 
 
 
617 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.24 
 
 
617 aa  92  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  22.19 
 
 
615 aa  91.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  23.51 
 
 
617 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.94 
 
 
660 aa  90.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.24 
 
 
617 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.45 
 
 
618 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.84 
 
 
618 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.69 
 
 
618 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  24.72 
 
 
618 aa  88.2  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  24.72 
 
 
618 aa  88.2  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  24.72 
 
 
618 aa  88.2  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.17 
 
 
618 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.17 
 
 
618 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  32.98 
 
 
704 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  27.24 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  20.68 
 
 
611 aa  82  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  23.11 
 
 
1070 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.1 
 
 
611 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.57 
 
 
506 aa  79  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  30.36 
 
 
609 aa  79  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  31.18 
 
 
1077 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.62 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.55 
 
 
645 aa  74.3  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.85 
 
 
1080 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  33.56 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  21.52 
 
 
1191 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.18 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  27.73 
 
 
643 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>