120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1703 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  46.78 
 
 
688 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  47.2 
 
 
740 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  46.43 
 
 
688 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  46.15 
 
 
688 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  47.55 
 
 
791 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  60.9 
 
 
764 aa  911    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  48.05 
 
 
765 aa  720    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  69.57 
 
 
818 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  66.21 
 
 
839 aa  1051    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  45.53 
 
 
735 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  61.04 
 
 
765 aa  910    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  60.53 
 
 
765 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  47.04 
 
 
689 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  61.04 
 
 
765 aa  910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  70.21 
 
 
830 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  46.08 
 
 
688 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  47.04 
 
 
689 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  61.53 
 
 
759 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  100 
 
 
782 aa  1581    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  45.41 
 
 
688 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  46.18 
 
 
688 aa  656    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  60.93 
 
 
765 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  59.71 
 
 
765 aa  888    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  73.49 
 
 
810 aa  1126    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  66.05 
 
 
832 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  47.12 
 
 
765 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  45.99 
 
 
691 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  43.36 
 
 
680 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  42.02 
 
 
678 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  41.67 
 
 
729 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  40.82 
 
 
739 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  41.09 
 
 
745 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  40.54 
 
 
691 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  40.54 
 
 
691 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  40.65 
 
 
686 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  40.62 
 
 
686 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  40.65 
 
 
686 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  40.54 
 
 
691 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  40.51 
 
 
686 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  40.62 
 
 
686 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  40.3 
 
 
686 aa  542  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  40.92 
 
 
686 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  40.79 
 
 
686 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  40.38 
 
 
686 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  40.79 
 
 
686 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  40.65 
 
 
686 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  49.69 
 
 
669 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  50.64 
 
 
677 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.15 
 
 
669 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  42.59 
 
 
762 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  29.9 
 
 
632 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.75 
 
 
761 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  40.81 
 
 
791 aa  323  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.42 
 
 
657 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  33.33 
 
 
667 aa  278  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  33.81 
 
 
664 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  55.35 
 
 
824 aa  266  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.85 
 
 
670 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  31.22 
 
 
669 aa  244  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.57 
 
 
656 aa  228  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  33.62 
 
 
697 aa  225  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  32 
 
 
649 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  28.02 
 
 
674 aa  158  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  26.81 
 
 
700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  24.59 
 
 
710 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.9 
 
 
704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.84 
 
 
665 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.78 
 
 
1077 aa  72.8  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  34.43 
 
 
895 aa  70.1  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  30.99 
 
 
1146 aa  67.4  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.48 
 
 
1061 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.8 
 
 
711 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  23.34 
 
 
609 aa  62  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.91 
 
 
587 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  23.16 
 
 
1061 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.94 
 
 
812 aa  55.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  23.55 
 
 
295 aa  54.7  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  24.64 
 
 
606 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  23.79 
 
 
794 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  22.86 
 
 
611 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.07 
 
 
612 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23 
 
 
604 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.91 
 
 
614 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  27.14 
 
 
660 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  27.83 
 
 
737 aa  51.6  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  27.14 
 
 
660 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  25.51 
 
 
1104 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  21.86 
 
 
1080 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  20.56 
 
 
1234 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.32 
 
 
677 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  20.56 
 
 
1238 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  23.64 
 
 
818 aa  50.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.9 
 
 
797 aa  50.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25 
 
 
675 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.17 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>