52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2806 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  93.05 
 
 		 1234 aa  2257    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 1238 aa  2472    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  50.85 
 
 		 1246 aa  1165    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1230 aa  998    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  34.33 
 
 		 1273 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1247 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1247 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  31.75 
 
 		 1278 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.25 
 
 		 1146 aa  164  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1174 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  23.74 
 
 		 1274 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1258 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1275 aa  141  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  26.34 
 
 		 1331 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1210 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  24.9 
 
 		 1239 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  23.85 
 
 		 1273 aa  115  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  23.62 
 
 		 1308 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1179 aa  107  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1146 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1175 aa  100  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1175 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28.8 
 
 		 1186 aa  91.7  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.41 
 
 		 1077 aa  89.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  24.29 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.4 
 
 		 656 aa  61.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  26.24 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  24.88 
 
 		 630 aa  52.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  25.93 
 
 		 470 aa  52.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  26.45 
 
 		 667 aa  52  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  30.86 
 
 		 649 aa  51.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.29 
 
 		 709 aa  50.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  25.93 
 
 		 630 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.49 
 
 		 649 aa  48.9  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.7 
 
 		 818 aa  48.9  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  21.25 
 
 		 794 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  25 
 
 		 1095 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  23.56 
 
 		 656 aa  47.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  24.6 
 
 		 862 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  21.74 
 
 		 839 aa  47  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  22.78 
 
 		 608 aa  46.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25 
 
 		 696 aa  46.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  22.04 
 
 		 599 aa  46.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  21.01 
 
 		 832 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  22.02 
 
 		 765 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  22.02 
 
 		 765 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  22.02 
 
 		 765 aa  45.8  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  21.52 
 
 		 645 aa  45.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  22.8 
 
 		 632 aa  45.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  27.98 
 
 		 699 aa  45.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  21.32 
 
 		 688 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>