40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0596 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  100 
 
 		 1186 aa  2285    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  24.77 
 
 		 1273 aa  194  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1146 aa  181  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1175 aa  170  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1175 aa  164  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1230 aa  159  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1234 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1246 aa  157  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1238 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1247 aa  132  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1258 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1247 aa  124  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  24.68 
 
 		 1239 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  25.92 
 
 		 1308 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  25.06 
 
 		 1273 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1174 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1179 aa  102  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1210 aa  99  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  26.88 
 
 		 1331 aa  97.8  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  26.33 
 
 		 1278 aa  85.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  25.51 
 
 		 1274 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.12 
 
 		 1146 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  27.07 
 
 		 999 aa  67  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  27.08 
 
 		 1077 aa  61.6  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  28.57 
 
 		 651 aa  51.6  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  27.41 
 
 		 643 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  26.05 
 
 		 656 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.48 
 
 		 656 aa  47.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  29.1 
 
 		 818 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  29.85 
 
 		 824 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  29.85 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  24.84 
 
 		 669 aa  46.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.34 
 
 		 655 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  25.53 
 
 		 602 aa  45.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25 
 
 		 632 aa  44.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>