26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6121 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  44.82 
 
 		 1274 aa  907    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  46.08 
 
 		 1273 aa  962    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  46.31 
 
 		 1239 aa  963    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  46.66 
 
 		 1308 aa  965    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  48.98 
 
 		 1275 aa  1157    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  100 
 
 		 1258 aa  2436    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  26.8 
 
 		 1331 aa  250  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1230 aa  186  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  23.47 
 
 		 1273 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  22.74 
 
 		 1278 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1247 aa  162  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1247 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1246 aa  159  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1234 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1238 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  27.87 
 
 		 1186 aa  99.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1146 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1210 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1174 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  21.68 
 
 		 1146 aa  59.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.52 
 
 		 1077 aa  58.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1175 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1179 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1175 aa  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  32.29 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  31.82 
 
 		 999 aa  45.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>