30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2736 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2027  AsmA  46.83 
 
 		 1273 aa  953    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  50.12 
 
 		 1239 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  46.74 
 
 		 1308 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 1275 aa  2503    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  45.66 
 
 		 1274 aa  929    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1258 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1238 aa  159  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1246 aa  157  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1234 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1230 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  22.94 
 
 		 1273 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1247 aa  152  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1247 aa  152  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  25.12 
 
 		 1278 aa  128  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  24.09 
 
 		 1186 aa  107  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25.11 
 
 		 1146 aa  96.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1146 aa  96.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.64 
 
 		 1077 aa  94.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1174 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1210 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  27.54 
 
 		 999 aa  56.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1179 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  28.69 
 
 		 862 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1175 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1175 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  27.07 
 
 		 762 aa  48.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1291 aa  45.8  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  26.2 
 
 		 632 aa  45.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  28 
 
 		 630 aa  45.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.45 
 
 		 695 aa  44.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>