67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1984 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  36.71 
 
 		 1278 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  100 
 
 		 1273 aa  2499    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1247 aa  714    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1247 aa  709    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1238 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1234 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1246 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1230 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  25.68 
 
 		 1331 aa  187  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1258 aa  173  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1275 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1210 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1146 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  23.46 
 
 		 1274 aa  138  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25.17 
 
 		 1146 aa  118  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  24.92 
 
 		 1308 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.28 
 
 		 1077 aa  107  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  26.3 
 
 		 1186 aa  107  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  22.84 
 
 		 1273 aa  97.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1179 aa  91.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  23.94 
 
 		 1239 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1174 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1175 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1175 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.87 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.89 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  25 
 
 		 630 aa  56.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  23.1 
 
 		 655 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.9 
 
 		 632 aa  55.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  25 
 
 		 630 aa  55.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  25.85 
 
 		 895 aa  55.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  52.44 
 
 		 373 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.48 
 
 		 656 aa  53.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.9 
 
 		 709 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.16 
 
 		 648 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  27.12 
 
 		 667 aa  52  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  31.7 
 
 		 696 aa  52  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  52.31 
 
 		 359 aa  51.6  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  30 
 
 		 818 aa  51.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  25 
 
 		 651 aa  51.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4616  hypothetical protein  56.14 
 
 		 345 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00528758  normal  0.0377754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  31.68 
 
 		 999 aa  50.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  31.87 
 
 		 228 aa  50.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  30.7 
 
 		 656 aa  50.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  25.15 
 
 		 764 aa  50.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1940  Cold-shock protein DNA-binding protein  40 
 
 		 290 aa  49.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  52.24 
 
 		 359 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.58 
 
 		 645 aa  48.9  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  24.54 
 
 		 765 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2752  hypothetical protein  32.35 
 
 		 281 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  29.84 
 
 		 341 aa  47.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  28.43 
 
 		 712 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  24.54 
 
 		 765 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  33.72 
 
 		 334 aa  48.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  24.54 
 
 		 765 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.35 
 
 		 677 aa  47.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0603  hypothetical protein  46.91 
 
 		 373 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  22.51 
 
 		 664 aa  47  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  27.5 
 
 		 818 aa  46.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  41.75 
 
 		 925 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  34.94 
 
 		 330 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  20.98 
 
 		 832 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  34.94 
 
 		 331 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  34.94 
 
 		 332 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.95 
 
 		 741 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  22.67 
 
 		 839 aa  45.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  31.11 
 
 		 318 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>