66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2059 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  100 
 
 
1210 aa  2246    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  49.78 
 
 
1146 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  46.44 
 
 
1175 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  46.45 
 
 
1179 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  46.09 
 
 
1175 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  76.98 
 
 
1174 aa  1603    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  25.42 
 
 
1246 aa  164  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  26.5 
 
 
1273 aa  162  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  25.57 
 
 
1230 aa  136  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  25.12 
 
 
1186 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.66 
 
 
1238 aa  128  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.48 
 
 
1234 aa  97.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  31.19 
 
 
1278 aa  94.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  27.84 
 
 
1275 aa  89.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  32.21 
 
 
1247 aa  84.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  32.21 
 
 
1247 aa  84  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  28.11 
 
 
1331 aa  84  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  40.35 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  40.35 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  36.22 
 
 
331 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  38.6 
 
 
333 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  38.6 
 
 
333 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25.78 
 
 
1146 aa  75.5  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  27.4 
 
 
1239 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  38.74 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  40.38 
 
 
318 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  44.59 
 
 
287 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  42.68 
 
 
303 aa  66.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  26.59 
 
 
1258 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  27.73 
 
 
1308 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  29.73 
 
 
2196 aa  60.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  26.81 
 
 
1077 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  25.42 
 
 
228 aa  60.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2556  phosphopantetheine-binding  50.67 
 
 
293 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  53.03 
 
 
373 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  30.37 
 
 
341 aa  56.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  40.83 
 
 
925 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3558  hypothetical protein  53.33 
 
 
268 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  56.9 
 
 
359 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 
905 aa  53.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  30 
 
 
999 aa  53.5  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2612  hypothetical protein  27.92 
 
 
295 aa  53.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 
898 aa  51.6  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2752  hypothetical protein  31.93 
 
 
281 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  33.58 
 
 
328 aa  51.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3763  hypothetical protein  31.3 
 
 
219 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  51.72 
 
 
359 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0054  CAP-Gly domain-containing protein  38.37 
 
 
319 aa  50.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000151719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  25.29 
 
 
642 aa  50.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  47.37 
 
 
964 aa  50.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  34.52 
 
 
1274 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 
959 aa  48.9  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.68 
 
 
364 aa  48.9  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 
990 aa  48.5  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  34 
 
 
792 aa  48.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 
164 aa  48.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 
295 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 
164 aa  48.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3250  CG2839  32.65 
 
 
231 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  30.91 
 
 
632 aa  47  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  31.09 
 
 
320 aa  46.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
328 aa  45.8  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 
884 aa  45.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0603  hypothetical protein  54.17 
 
 
373 aa  45.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0285  hypothetical protein  28.28 
 
 
193 aa  45.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000769793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2394  hypothetical protein  26.19 
 
 
149 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>