129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2321 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  74.15 
 
 		 764 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  74.03 
 
 		 818 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  100 
 
 		 839 aa  1684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  63.31 
 
 		 765 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  73.08 
 
 		 765 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  63.31 
 
 		 765 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  74.14 
 
 		 824 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  74.35 
 
 		 830 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  74.08 
 
 		 759 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  60.75 
 
 		 782 aa  933    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  73 
 
 		 765 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  71.46 
 
 		 765 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  70.24 
 
 		 810 aa  1144    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  91.66 
 
 		 832 aa  1461    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  48.18 
 
 		 765 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  54.64 
 
 		 765 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  58.74 
 
 		 740 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  55.74 
 
 		 689 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  55.32 
 
 		 689 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  55.85 
 
 		 688 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  55.86 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  52.72 
 
 		 680 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  52.04 
 
 		 688 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  51.84 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  54.66 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  51.77 
 
 		 688 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  52.33 
 
 		 791 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  50.51 
 
 		 735 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  52 
 
 		 691 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  37.86 
 
 		 739 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  53.53 
 
 		 669 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  50.64 
 
 		 678 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  50.86 
 
 		 677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  46.59 
 
 		 686 aa  466  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  45.98 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  45.98 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  45.98 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  45.98 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  45.98 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  45.98 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  45.98 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  45.58 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  45.38 
 
 		 686 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  50.82 
 
 		 745 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  45.98 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  45.58 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  50.35 
 
 		 729 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  45.58 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  45.78 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  42.33 
 
 		 762 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  40.43 
 
 		 761 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  36.42 
 
 		 669 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  40.71 
 
 		 791 aa  319  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  37.09 
 
 		 632 aa  318  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  33.61 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.97 
 
 		 657 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  35.52 
 
 		 664 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  33.12 
 
 		 669 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.73 
 
 		 670 aa  258  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.8 
 
 		 656 aa  228  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  33.83 
 
 		 697 aa  227  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  31.97 
 
 		 649 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  30.59 
 
 		 674 aa  174  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  27.23 
 
 		 710 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  26.24 
 
 		 700 aa  144  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.4 
 
 		 704 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  33.8 
 
 		 1146 aa  80.1  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.78 
 
 		 1077 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.67 
 
 		 665 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  29.51 
 
 		 895 aa  64.3  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  24.48 
 
 		 482 aa  62  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.09 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.76 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  27.08 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.91 
 
 		 611 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.79 
 
 		 711 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.23 
 
 		 812 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  28.45 
 
 		 794 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  28.57 
 
 		 604 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  25.36 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.37 
 
 		 606 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.91 
 
 		 606 aa  54.3  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  23.05 
 
 		 295 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  30.77 
 
 		 587 aa  52.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.47 
 
 		 695 aa  52.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.59 
 
 		 712 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.58 
 
 		 818 aa  52  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.07 
 
 		 612 aa  51.6  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  21.43 
 
 		 1061 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  26.29 
 
 		 609 aa  50.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  25 
 
 		 607 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  26.09 
 
 		 614 aa  49.3  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.62 
 
 		 696 aa  49.3  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  28.7 
 
 		 719 aa  49.3  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  25.4 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>