40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1136 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  100 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  56.36 
 
 		 609 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  29.33 
 
 		 737 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  26.6 
 
 		 704 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  24.71 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  25.19 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.71 
 
 		 587 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  22.79 
 
 		 895 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.55 
 
 		 782 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  23.68 
 
 		 832 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  26.99 
 
 		 669 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  23.27 
 
 		 677 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  24 
 
 		 765 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  25.29 
 
 		 759 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  23.4 
 
 		 839 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  24.7 
 
 		 765 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  24.9 
 
 		 824 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  24.7 
 
 		 765 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  24 
 
 		 765 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  24.7 
 
 		 765 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  24.9 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  27.78 
 
 		 729 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  26.03 
 
 		 678 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  25.86 
 
 		 764 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  23.67 
 
 		 657 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.13 
 
 		 632 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  25.35 
 
 		 669 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  25.22 
 
 		 761 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  24.89 
 
 		 745 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  24.89 
 
 		 739 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  26.88 
 
 		 664 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  24.48 
 
 		 688 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  24.08 
 
 		 674 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  25.25 
 
 		 791 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  24.37 
 
 		 688 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>