114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1499 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  47.95 
 
 
740 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  47.21 
 
 
791 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  86.28 
 
 
764 aa  1248    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  63.8 
 
 
839 aa  986    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  86.82 
 
 
765 aa  1259    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  80.98 
 
 
765 aa  1162    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  86.82 
 
 
765 aa  1259    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  85.02 
 
 
824 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  49.14 
 
 
765 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  100 
 
 
759 aa  1524    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  61.86 
 
 
782 aa  927    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  85.49 
 
 
765 aa  1252    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  80.85 
 
 
765 aa  1176    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  65.33 
 
 
810 aa  978    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  62.86 
 
 
832 aa  999    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  49.48 
 
 
765 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  45.34 
 
 
735 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  45.09 
 
 
688 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  42.41 
 
 
729 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  41.71 
 
 
739 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  41.19 
 
 
745 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  55.26 
 
 
689 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  56.26 
 
 
689 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  56.9 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  56.6 
 
 
688 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  56.39 
 
 
688 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  55.56 
 
 
688 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  54.73 
 
 
688 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  53.21 
 
 
680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  54.19 
 
 
691 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  54.31 
 
 
669 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  50.97 
 
 
677 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  49.46 
 
 
678 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  47.77 
 
 
691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  47.77 
 
 
691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  47.56 
 
 
686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  47.77 
 
 
691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  47.77 
 
 
686 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  47.77 
 
 
686 aa  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  47.77 
 
 
686 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  47.77 
 
 
686 aa  452  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  47.77 
 
 
686 aa  452  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  46.53 
 
 
686 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  46.33 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  46.33 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  46.33 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  77.43 
 
 
818 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  76.96 
 
 
830 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  41.37 
 
 
762 aa  349  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  38.17 
 
 
669 aa  333  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  38.05 
 
 
632 aa  330  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.81 
 
 
761 aa  328  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  39.63 
 
 
791 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  35.53 
 
 
667 aa  300  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  37.47 
 
 
657 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  36.12 
 
 
664 aa  276  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.19 
 
 
670 aa  266  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  32.78 
 
 
669 aa  256  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  34.04 
 
 
697 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.49 
 
 
656 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  32.16 
 
 
649 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  29.35 
 
 
674 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  28.07 
 
 
700 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  27.03 
 
 
710 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.95 
 
 
704 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.49 
 
 
665 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.87 
 
 
1077 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  33.33 
 
 
1146 aa  75.1  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  29.06 
 
 
895 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.85 
 
 
587 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.25 
 
 
677 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.28 
 
 
797 aa  57.4  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25 
 
 
893 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  22.4 
 
 
1278 aa  57.4  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  26.04 
 
 
482 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.48 
 
 
1061 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.04 
 
 
745 aa  55.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  27.05 
 
 
818 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.35 
 
 
794 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  25.53 
 
 
703 aa  54.3  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  25.29 
 
 
295 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  30 
 
 
342 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.89 
 
 
789 aa  53.5  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  30.97 
 
 
711 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.01 
 
 
506 aa  52.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.89 
 
 
709 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.92 
 
 
712 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.07 
 
 
612 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  26.62 
 
 
762 aa  50.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.67 
 
 
742 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  24.21 
 
 
1061 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  27.35 
 
 
812 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  30.91 
 
 
640 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  30.48 
 
 
719 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>