156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1019 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  100 
 
 		 640 aa  1257    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  33.55 
 
 		 611 aa  324  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  33.5 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  32.86 
 
 		 614 aa  323  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  33.44 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  33.22 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  32.85 
 
 		 606 aa  316  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  33.55 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  33.05 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  32.01 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  32.54 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  32.54 
 
 		 606 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  33.17 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  32.3 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  32.03 
 
 		 608 aa  300  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  33.01 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  32.1 
 
 		 612 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  27.87 
 
 		 719 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.19 
 
 		 696 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  27.3 
 
 		 699 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  27.93 
 
 		 703 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  29.98 
 
 		 695 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  28.51 
 
 		 695 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25.57 
 
 		 677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.27 
 
 		 682 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.96 
 
 		 709 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.55 
 
 		 812 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  29.19 
 
 		 742 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  29.1 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.15 
 
 		 797 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.64 
 
 		 893 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.7 
 
 		 732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.31 
 
 		 646 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.3 
 
 		 502 aa  122  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  28.3 
 
 		 508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  21.79 
 
 		 615 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  20.7 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  28.31 
 
 		 741 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  20.83 
 
 		 618 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  20.83 
 
 		 618 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.04 
 
 		 794 aa  103  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  20.83 
 
 		 618 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.92 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  20.87 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.33 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  20.34 
 
 		 618 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  20.34 
 
 		 618 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.91 
 
 		 660 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  20.34 
 
 		 618 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  20.68 
 
 		 618 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.28 
 
 		 617 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  20.45 
 
 		 599 aa  97.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.28 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  24.32 
 
 		 725 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.28 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.28 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.28 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  20.28 
 
 		 617 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  20.12 
 
 		 617 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  20.12 
 
 		 617 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  26 
 
 		 750 aa  94  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  24.94 
 
 		 741 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  19.82 
 
 		 617 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  21.38 
 
 		 611 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  26.64 
 
 		 750 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.44 
 
 		 748 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  21.12 
 
 		 611 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.94 
 
 		 748 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.31 
 
 		 741 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  22.84 
 
 		 704 aa  88.2  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.89 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.44 
 
 		 748 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  26.64 
 
 		 826 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  26.64 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.41 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  24.56 
 
 		 748 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.17 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  23.68 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  20.49 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  25 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.69 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  23.91 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  25.31 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  24.64 
 
 		 1013 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.4 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.43 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  26.53 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  32.26 
 
 		 506 aa  72  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  20.89 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  25.37 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  28.22 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  21.09 
 
 		 655 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.33 
 
 		 701 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  28.22 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  20.73 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  24.62 
 
 		 1079 aa  64.3  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  21.55 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  20.35 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  32.03 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>