109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2268 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  100 
 
 
818 aa  1635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  62.9 
 
 
839 aa  986    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  95.82 
 
 
824 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  95.62 
 
 
830 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  65.09 
 
 
782 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  54.9 
 
 
689 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  53.5 
 
 
765 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  56.08 
 
 
689 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  53.5 
 
 
765 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  57.02 
 
 
688 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  55.76 
 
 
688 aa  532  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  55.77 
 
 
688 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  55.77 
 
 
688 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  55.14 
 
 
688 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  55.41 
 
 
740 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  54.6 
 
 
688 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  55.02 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  55.46 
 
 
691 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  51.63 
 
 
791 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  50.87 
 
 
735 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  52.21 
 
 
669 aa  469  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  50.54 
 
 
677 aa  465  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  47.93 
 
 
678 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  46.9 
 
 
691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  46.9 
 
 
691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  46.9 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  46.9 
 
 
691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  46.9 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  46.9 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  46.9 
 
 
686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  50.12 
 
 
745 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  46.9 
 
 
686 aa  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  50.12 
 
 
739 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  47.13 
 
 
686 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  50.35 
 
 
729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  77.92 
 
 
765 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  77.92 
 
 
765 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  78.07 
 
 
765 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  77.38 
 
 
764 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  69.05 
 
 
759 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  41.2 
 
 
762 aa  352  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  38.8 
 
 
669 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  67.74 
 
 
765 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  67.74 
 
 
765 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  37.63 
 
 
632 aa  330  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.33 
 
 
761 aa  325  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  38.46 
 
 
791 aa  312  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  52.9 
 
 
832 aa  307  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  34.25 
 
 
667 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  35.87 
 
 
657 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  56.76 
 
 
810 aa  277  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  36.04 
 
 
664 aa  276  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.02 
 
 
670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  31.52 
 
 
669 aa  243  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  35.26 
 
 
697 aa  240  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.12 
 
 
656 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  31.02 
 
 
649 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  29.39 
 
 
674 aa  167  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.16 
 
 
710 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  27.47 
 
 
700 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.58 
 
 
704 aa  100  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  27.86 
 
 
1077 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.9 
 
 
665 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  32.68 
 
 
1146 aa  78.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  28.57 
 
 
895 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  33.07 
 
 
677 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.21 
 
 
711 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  28.45 
 
 
818 aa  58.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.01 
 
 
797 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  25.19 
 
 
295 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  30.43 
 
 
812 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.14 
 
 
587 aa  55.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.76 
 
 
725 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  32.48 
 
 
712 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  30.56 
 
 
719 aa  52.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.92 
 
 
789 aa  52.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  29.63 
 
 
703 aa  52.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  29.36 
 
 
342 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  31.16 
 
 
762 aa  51.6  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.27 
 
 
609 aa  50.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  25.13 
 
 
1278 aa  50.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  26.98 
 
 
695 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  30.15 
 
 
709 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.82 
 
 
508 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.07 
 
 
612 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.82 
 
 
502 aa  48.9  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  24.09 
 
 
1094 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.34 
 
 
745 aa  48.5  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  26.98 
 
 
695 aa  48.5  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  23.17 
 
 
893 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>