154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0557 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  62.93 
 
 
695 aa  908    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  100 
 
 
703 aa  1406    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  61.97 
 
 
695 aa  897    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  46.32 
 
 
719 aa  622  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  33.13 
 
 
606 aa  346  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  33.38 
 
 
606 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  33.79 
 
 
606 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  33.54 
 
 
606 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  33.33 
 
 
608 aa  334  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  30.42 
 
 
612 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  30.53 
 
 
611 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  29.29 
 
 
606 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  31.96 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.02 
 
 
742 aa  271  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  33.39 
 
 
607 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  31.22 
 
 
712 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  27.18 
 
 
699 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  33.39 
 
 
607 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  33.39 
 
 
607 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  32.84 
 
 
607 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.72 
 
 
640 aa  248  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  32.26 
 
 
614 aa  241  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  34.25 
 
 
606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  35.52 
 
 
604 aa  230  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.86 
 
 
732 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  29.75 
 
 
812 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  31.63 
 
 
893 aa  194  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  26.24 
 
 
682 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.38 
 
 
789 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.1 
 
 
741 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  23.37 
 
 
618 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  23.37 
 
 
618 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  23.37 
 
 
618 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  25.17 
 
 
741 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  22.19 
 
 
611 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  22.1 
 
 
615 aa  161  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  22.71 
 
 
617 aa  161  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.84 
 
 
797 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.93 
 
 
677 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.3 
 
 
618 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.3 
 
 
618 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.3 
 
 
618 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.7 
 
 
709 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  23.83 
 
 
725 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.16 
 
 
618 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.02 
 
 
618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.78 
 
 
611 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  23.22 
 
 
762 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.69 
 
 
748 aa  144  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.6 
 
 
741 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.32 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  21.59 
 
 
599 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  24.89 
 
 
675 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  23.94 
 
 
750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.08 
 
 
711 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.27 
 
 
750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  27.6 
 
 
696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.97 
 
 
660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.83 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.84 
 
 
747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.47 
 
 
740 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.1 
 
 
741 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  28.14 
 
 
649 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.43 
 
 
748 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  28.12 
 
 
640 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.8 
 
 
794 aa  128  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.91 
 
 
748 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.47 
 
 
748 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  23.78 
 
 
604 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  24.13 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  24.38 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  29.5 
 
 
705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  24.13 
 
 
617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  24.13 
 
 
617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  24.13 
 
 
617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.88 
 
 
617 aa  111  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.63 
 
 
617 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.63 
 
 
617 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.92 
 
 
655 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  29.15 
 
 
826 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.76 
 
 
1013 aa  104  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  27.33 
 
 
508 aa  104  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.24 
 
 
502 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  20.8 
 
 
656 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.44 
 
 
643 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  25 
 
 
602 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.32 
 
 
648 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.18 
 
 
645 aa  94  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  23.29 
 
 
649 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.41 
 
 
745 aa  89  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  20.84 
 
 
701 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.22 
 
 
654 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  28.63 
 
 
609 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  21.48 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  23.88 
 
 
655 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  22.31 
 
 
711 aa  71.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  20.84 
 
 
611 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  22.45 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.21 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.55 
 
 
1077 aa  67.4  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>