91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1200 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  100 
 
 
700 aa  1409    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  26.25 
 
 
632 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  26.92 
 
 
669 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  23.84 
 
 
664 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  24.92 
 
 
670 aa  183  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  26.16 
 
 
657 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  27.5 
 
 
678 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  27.19 
 
 
765 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  27.04 
 
 
691 aa  160  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  27.04 
 
 
691 aa  160  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  27.04 
 
 
691 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  27.04 
 
 
686 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  27.04 
 
 
686 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  27.04 
 
 
686 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  26.32 
 
 
688 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  27.04 
 
 
686 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.98 
 
 
669 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  27.04 
 
 
686 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  25.92 
 
 
688 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  28.07 
 
 
739 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  28.51 
 
 
729 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  28.07 
 
 
745 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  27.59 
 
 
765 aa  157  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  27.9 
 
 
759 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.15 
 
 
656 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  27.59 
 
 
765 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  27.59 
 
 
765 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  26.77 
 
 
765 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  26.75 
 
 
680 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25.6 
 
 
688 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  26.89 
 
 
782 aa  154  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  26.36 
 
 
686 aa  153  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  23.96 
 
 
735 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  26.11 
 
 
649 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  26.76 
 
 
764 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  22.3 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  26.18 
 
 
810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  25.28 
 
 
688 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  27.63 
 
 
765 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  25.21 
 
 
686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  25.21 
 
 
686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  25.21 
 
 
686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  27.36 
 
 
791 aa  148  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  25.21 
 
 
686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  27.01 
 
 
765 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  25.83 
 
 
688 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  25.04 
 
 
686 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  27.07 
 
 
830 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  27.07 
 
 
824 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  24.88 
 
 
688 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  25.86 
 
 
689 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  26.15 
 
 
791 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  26.45 
 
 
832 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  24.73 
 
 
740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  23.98 
 
 
691 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  24.48 
 
 
762 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  25.51 
 
 
689 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  26.05 
 
 
839 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  23.98 
 
 
669 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.89 
 
 
677 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  27.47 
 
 
818 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  25.24 
 
 
761 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  22.64 
 
 
674 aa  132  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  24.17 
 
 
710 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  24.03 
 
 
697 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.17 
 
 
704 aa  90.9  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.34 
 
 
587 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.95 
 
 
665 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  26.03 
 
 
737 aa  67.8  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.78 
 
 
656 aa  58.9  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  21.29 
 
 
742 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  23.21 
 
 
893 aa  50.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.88 
 
 
508 aa  48.9  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  22.26 
 
 
895 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  22.18 
 
 
1095 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.88 
 
 
502 aa  48.5  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.83 
 
 
655 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3872  hypothetical protein  30.52 
 
 
1188 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  23.65 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  30.33 
 
 
1079 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  24.79 
 
 
1013 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.13 
 
 
699 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.05 
 
 
649 aa  45.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  27.91 
 
 
1080 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  21.48 
 
 
640 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.32 
 
 
794 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>