104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1711 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  80.03 
 
 		 764 aa  1164    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  62.85 
 
 		 839 aa  956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  83.79 
 
 		 765 aa  1232    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  100 
 
 		 765 aa  1540    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  83.79 
 
 		 765 aa  1232    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  80.03 
 
 		 759 aa  1170    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  60.82 
 
 		 782 aa  904    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  84.05 
 
 		 765 aa  1231    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  98.17 
 
 		 765 aa  1521    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  62.52 
 
 		 810 aa  940    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  63.77 
 
 		 832 aa  962    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  47.64 
 
 		 765 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  47.71 
 
 		 765 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  43.47 
 
 		 688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  43.07 
 
 		 688 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  43.76 
 
 		 688 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  42.67 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  55.33 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  55.12 
 
 		 689 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  53.29 
 
 		 688 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  52.5 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  55.79 
 
 		 680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  39.08 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  54.39 
 
 		 740 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  38.39 
 
 		 729 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  37.32 
 
 		 739 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  53.42 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  52.74 
 
 		 669 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  50.75 
 
 		 677 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  49.15 
 
 		 735 aa  465  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  36.56 
 
 		 745 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  47.95 
 
 		 678 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  46.95 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  47.15 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  47.15 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  47.15 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  46.54 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  47.15 
 
 		 686 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  47.15 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  47.15 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  47.15 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  47.15 
 
 		 686 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  46.95 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  46.95 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  46.95 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  42 
 
 		 762 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  67.7 
 
 		 818 aa  346  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  67.28 
 
 		 824 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  67.28 
 
 		 830 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.35 
 
 		 761 aa  328  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  37.66 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  37.2 
 
 		 669 aa  317  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  39.76 
 
 		 791 aa  316  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  33.82 
 
 		 667 aa  281  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.38 
 
 		 657 aa  277  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  35.83 
 
 		 664 aa  266  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  33.4 
 
 		 670 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  34.24 
 
 		 669 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  33.4 
 
 		 697 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.88 
 
 		 656 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  31.6 
 
 		 649 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  49.69 
 
 		 791 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  30 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.65 
 
 		 710 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  27.63 
 
 		 700 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.09 
 
 		 704 aa  105  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.6 
 
 		 665 aa  75.1  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.41 
 
 		 1077 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  26.62 
 
 		 1146 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  27.61 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.1 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.7 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  24.4 
 
 		 295 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  23.96 
 
 		 1061 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.47 
 
 		 789 aa  53.5  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  25.41 
 
 		 818 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  26.32 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  24.05 
 
 		 892 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.27 
 
 		 342 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  23.85 
 
 		 711 aa  51.2  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  24.29 
 
 		 703 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  30.48 
 
 		 719 aa  50.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  25.52 
 
 		 482 aa  49.3  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  22.49 
 
 		 1079 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  23.36 
 
 		 797 aa  48.9  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.52 
 
 		 725 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  26.83 
 
 		 695 aa  48.5  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.31 
 
 		 745 aa  48.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  26.42 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  21.35 
 
 		 1278 aa  47.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  21.74 
 
 		 606 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  25.44 
 
 		 612 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.72 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  28.1 
 
 		 682 aa  46.2  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  23.58 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>