104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0566 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  53.12 
 
 		 691 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  53.12 
 
 		 691 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  74.71 
 
 		 688 aa  1056    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  76.89 
 
 		 688 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  76.02 
 
 		 688 aa  1079    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  100 
 
 		 691 aa  1392    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  66.81 
 
 		 689 aa  910    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  53.41 
 
 		 686 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  63.98 
 
 		 680 aa  852    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  74.42 
 
 		 688 aa  1052    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  66.38 
 
 		 689 aa  912    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  49.8 
 
 		 745 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  53.12 
 
 		 686 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  52.98 
 
 		 686 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  60.82 
 
 		 678 aa  825    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  45.29 
 
 		 782 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  51.09 
 
 		 729 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  74.86 
 
 		 688 aa  1054    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  50.4 
 
 		 739 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  53.12 
 
 		 691 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  53.12 
 
 		 686 aa  727    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  75.18 
 
 		 688 aa  1038    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  53.12 
 
 		 686 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  45.63 
 
 		 765 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  53.85 
 
 		 686 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  53.85 
 
 		 686 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  53.85 
 
 		 686 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  53.7 
 
 		 686 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  53.85 
 
 		 686 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  53.12 
 
 		 686 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  60.18 
 
 		 677 aa  819    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  45.7 
 
 		 765 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  46.75 
 
 		 740 aa  622  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  45.08 
 
 		 735 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  42.78 
 
 		 791 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  44.31 
 
 		 669 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  54.33 
 
 		 824 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  54.12 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  51.94 
 
 		 810 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  54.89 
 
 		 818 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  53.94 
 
 		 832 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  54 
 
 		 759 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  53.59 
 
 		 839 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  54.21 
 
 		 765 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  54 
 
 		 765 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  54 
 
 		 765 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  53.78 
 
 		 764 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  53.35 
 
 		 765 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  52.92 
 
 		 765 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  35.75 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  39.27 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  33.63 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.29 
 
 		 761 aa  364  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  37.2 
 
 		 791 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  32.23 
 
 		 667 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  35.11 
 
 		 669 aa  346  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  33.38 
 
 		 670 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  32.53 
 
 		 664 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  33.23 
 
 		 657 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  28.76 
 
 		 656 aa  273  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.59 
 
 		 649 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  29.64 
 
 		 697 aa  256  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.14 
 
 		 674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  24.61 
 
 		 710 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.6 
 
 		 704 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.12 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.3 
 
 		 665 aa  94.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.19 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  22.66 
 
 		 895 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  22.62 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  25.94 
 
 		 818 aa  67.8  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.18 
 
 		 1077 aa  67.4  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.86 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  32.76 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.71 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.43 
 
 		 797 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  26.4 
 
 		 604 aa  53.9  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  23.81 
 
 		 1061 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.68 
 
 		 1061 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.43 
 
 		 660 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  23.6 
 
 		 506 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.93 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.62 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  24.43 
 
 		 660 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.58 
 
 		 675 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  28.43 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  20.86 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  21.46 
 
 		 609 aa  48.5  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  30.43 
 
 		 265 aa  48.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.58 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  19.58 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.11 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  29.8 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.44 
 
 		 789 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.25 
 
 		 741 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>