166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4644 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  100 
 
 		 649 aa  1298    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.69 
 
 		 657 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.49 
 
 		 669 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.27 
 
 		 667 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  33.44 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  31.64 
 
 		 678 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.8 
 
 		 656 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  31.02 
 
 		 688 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  30.77 
 
 		 688 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  29.72 
 
 		 689 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  30.01 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  30.88 
 
 		 670 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  29.68 
 
 		 710 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  30.83 
 
 		 664 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  29.87 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  29.76 
 
 		 688 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  29.81 
 
 		 688 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  29.76 
 
 		 688 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  27.86 
 
 		 765 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  28.66 
 
 		 686 aa  256  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  29.68 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  27.57 
 
 		 765 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  30.61 
 
 		 669 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  28.34 
 
 		 735 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  29.42 
 
 		 791 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  28.17 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  28.17 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  28.17 
 
 		 686 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  28.17 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  28.17 
 
 		 686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  28.17 
 
 		 686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  28.17 
 
 		 686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  28.17 
 
 		 686 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  27.98 
 
 		 686 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  27.98 
 
 		 686 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  29.04 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  27.98 
 
 		 686 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  27.98 
 
 		 686 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  27.98 
 
 		 686 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  27.54 
 
 		 740 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  28.57 
 
 		 680 aa  239  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  28.55 
 
 		 677 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  28.66 
 
 		 669 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  30.62 
 
 		 762 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  33.19 
 
 		 739 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  33.19 
 
 		 745 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  32 
 
 		 782 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  30.85 
 
 		 810 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  31.97 
 
 		 839 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  31.18 
 
 		 832 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  32.56 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  32.56 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  32.07 
 
 		 759 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  32.56 
 
 		 765 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  29.15 
 
 		 674 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  31.65 
 
 		 764 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  30.35 
 
 		 830 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  31.02 
 
 		 818 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  30.35 
 
 		 824 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  31.98 
 
 		 765 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  31.77 
 
 		 765 aa  210  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  28.22 
 
 		 697 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  28.57 
 
 		 791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  28.43 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  26.11 
 
 		 700 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.25 
 
 		 704 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  22.4 
 
 		 665 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  24.21 
 
 		 737 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  29.6 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.39 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.26 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  22.94 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.52 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  25.3 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  21.32 
 
 		 606 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  20.69 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.94 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.59 
 
 		 607 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.46 
 
 		 895 aa  72  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  35.26 
 
 		 1077 aa  70.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  22.09 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1247 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.96 
 
 		 1061 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.56 
 
 		 699 aa  67.8  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  20.35 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  23.58 
 
 		 1061 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  24.86 
 
 		 748 aa  67.4  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.03 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  20.75 
 
 		 741 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1247 aa  65.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  19.71 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.03 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  24.58 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.03 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  21.87 
 
 		 607 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>