74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1408 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1984  AsmA  37.23 
 
 		 1273 aa  723    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  100 
 
 		 1247 aa  2481    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  99.6 
 
 		 1247 aa  2471    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  80.28 
 
 		 1278 aa  2007    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1246 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1234 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1238 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1230 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1258 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1275 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  25.21 
 
 		 1331 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.84 
 
 		 1146 aa  113  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  24.34 
 
 		 1274 aa  108  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  25.29 
 
 		 1239 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.76 
 
 		 1077 aa  107  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  26 
 
 		 1273 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  25.89 
 
 		 1308 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1210 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1146 aa  92  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1175 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1174 aa  82.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1179 aa  82.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  27.12 
 
 		 1186 aa  78.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1175 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.63 
 
 		 643 aa  70.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  25.57 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  26.47 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  32.43 
 
 		 696 aa  61.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  28.85 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.04 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.47 
 
 		 648 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  28.93 
 
 		 634 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.51 
 
 		 677 aa  57  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.17 
 
 		 667 aa  55.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0065  hypothetical protein  34.69 
 
 		 461 aa  55.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.84 
 
 		 632 aa  55.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  24.35 
 
 		 1079 aa  52.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.35 
 
 		 709 aa  52.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  23.5 
 
 		 764 aa  51.6  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  28.42 
 
 		 1275 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  23.37 
 
 		 740 aa  51.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  24.29 
 
 		 765 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  24.29 
 
 		 765 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  24.29 
 
 		 765 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  21.86 
 
 		 759 aa  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.4 
 
 		 797 aa  50.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  29.27 
 
 		 470 aa  49.3  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  27.82 
 
 		 999 aa  49.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.45 
 
 		 645 aa  48.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  27.86 
 
 		 632 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  21.43 
 
 		 669 aa  48.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  26.19 
 
 		 1061 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  22.55 
 
 		 686 aa  47  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  26.13 
 
 		 862 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.55 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  22.55 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.05 
 
 		 732 aa  46.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  22.55 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  22.55 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  23.85 
 
 		 651 aa  46.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.55 
 
 		 691 aa  46.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  18.82 
 
 		 832 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.55 
 
 		 691 aa  46.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  20 
 
 		 678 aa  46.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  25.74 
 
 		 895 aa  46.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.22 
 
 		 655 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.55 
 
 		 691 aa  46.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1080 aa  45.8  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  19.65 
 
 		 740 aa  45.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.2 
 
 		 695 aa  45.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.56 
 
 		 606 aa  45.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  20.71 
 
 		 741 aa  45.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  22.56 
 
 		 606 aa  45.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  20.61 
 
 		 741 aa  45.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>