134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2008 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2566  asmA protein  74.46 
 
 
606 aa  903    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  98.52 
 
 
607 aa  1186    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  77.27 
 
 
606 aa  915    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  77.43 
 
 
606 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  57.85 
 
 
606 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  78.09 
 
 
606 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  98.68 
 
 
607 aa  1186    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  53.41 
 
 
614 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  76.73 
 
 
608 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  100 
 
 
607 aa  1203    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  57.64 
 
 
611 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  54.55 
 
 
612 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  98.35 
 
 
607 aa  1181    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  57.05 
 
 
606 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  51.73 
 
 
604 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  47.48 
 
 
614 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  32.94 
 
 
695 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  32.26 
 
 
640 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  32.32 
 
 
703 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  34.27 
 
 
695 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.96 
 
 
732 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  32.64 
 
 
719 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  27.23 
 
 
696 aa  208  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  27.82 
 
 
677 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  34.31 
 
 
712 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  38.21 
 
 
699 aa  183  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.51 
 
 
709 aa  178  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  34.56 
 
 
812 aa  170  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.47 
 
 
682 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  33.24 
 
 
893 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  29.39 
 
 
742 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  24.08 
 
 
617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.73 
 
 
797 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  24.08 
 
 
617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  24.08 
 
 
617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.92 
 
 
617 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.92 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.92 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.92 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.76 
 
 
617 aa  146  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  23.76 
 
 
617 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  22.78 
 
 
615 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  23.1 
 
 
618 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  23.1 
 
 
618 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  23.1 
 
 
618 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  25.08 
 
 
640 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.64 
 
 
611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  24.16 
 
 
611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.51 
 
 
618 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.51 
 
 
618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.07 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.54 
 
 
618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.35 
 
 
618 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.19 
 
 
618 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  25.65 
 
 
705 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.81 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.23 
 
 
502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  22.24 
 
 
611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  24.4 
 
 
649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  29.82 
 
 
794 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.6 
 
 
704 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  31.58 
 
 
660 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.2 
 
 
660 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.04 
 
 
826 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  29.33 
 
 
675 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.91 
 
 
646 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.12 
 
 
602 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  24.23 
 
 
599 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.25 
 
 
1013 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.93 
 
 
747 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  26.08 
 
 
711 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.83 
 
 
789 aa  94.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.92 
 
 
748 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.88 
 
 
748 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  27.08 
 
 
655 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.01 
 
 
748 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.78 
 
 
748 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.46 
 
 
745 aa  89  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  25.93 
 
 
611 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  25.48 
 
 
740 aa  87  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.28 
 
 
741 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.92 
 
 
632 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  23.03 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  27.21 
 
 
741 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.05 
 
 
750 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  22.72 
 
 
711 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.21 
 
 
649 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  23.8 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  26.51 
 
 
656 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.04 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  24.93 
 
 
762 aa  77.8  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.91 
 
 
725 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  27.78 
 
 
701 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.46 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.31 
 
 
656 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25 
 
 
643 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  22.17 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  29.92 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  35.14 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.71 
 
 
648 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>