68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1365 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  80.2 
 
 
1278 aa  2005    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  99.6 
 
 
1247 aa  2471    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  100 
 
 
1247 aa  2480    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  37.31 
 
 
1273 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  33.2 
 
 
1246 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  32.91 
 
 
1238 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  32.88 
 
 
1234 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  30.99 
 
 
1230 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  23.1 
 
 
1258 aa  160  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  22.78 
 
 
1275 aa  153  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  25.04 
 
 
1331 aa  136  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.65 
 
 
1146 aa  113  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.37 
 
 
1077 aa  107  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  25.06 
 
 
1239 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  26 
 
 
1273 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  23.99 
 
 
1274 aa  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  26.29 
 
 
1308 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  32.77 
 
 
1210 aa  100  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  24.24 
 
 
1146 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  25.85 
 
 
1175 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  25.76 
 
 
1174 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  25.41 
 
 
1179 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  27.54 
 
 
1186 aa  81.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.63 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  27.75 
 
 
1175 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  26.07 
 
 
649 aa  65.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.04 
 
 
656 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  28.85 
 
 
737 aa  59.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.98 
 
 
654 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  31.53 
 
 
696 aa  58.9  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  28.93 
 
 
634 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.17 
 
 
667 aa  55.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0065  hypothetical protein  34.69 
 
 
461 aa  55.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.84 
 
 
632 aa  55.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.96 
 
 
648 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.18 
 
 
677 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  24.35 
 
 
1079 aa  52.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  23.5 
 
 
764 aa  51.6  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.35 
 
 
709 aa  51.6  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  28.42 
 
 
1275 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  24.29 
 
 
765 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  21.86 
 
 
759 aa  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  24.29 
 
 
765 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  24.29 
 
 
765 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.4 
 
 
797 aa  49.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  26.73 
 
 
895 aa  48.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  22.83 
 
 
740 aa  48.5  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  27.82 
 
 
999 aa  48.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  21.43 
 
 
669 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  27.86 
 
 
632 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  22.55 
 
 
686 aa  47.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.39 
 
 
645 aa  47.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  26.13 
 
 
862 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  20 
 
 
678 aa  46.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  28.66 
 
 
470 aa  46.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  26.17 
 
 
669 aa  46.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  18.82 
 
 
832 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  30.91 
 
 
342 aa  46.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.05 
 
 
732 aa  46.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.2 
 
 
695 aa  45.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  23.85 
 
 
651 aa  45.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  24.52 
 
 
1080 aa  45.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  25.4 
 
 
1061 aa  45.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.28 
 
 
691 aa  44.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.28 
 
 
686 aa  44.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.56 
 
 
606 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.28 
 
 
691 aa  44.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.28 
 
 
691 aa  44.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>