32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1421 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  100 
 
 
1331 aa  2514    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  26.24 
 
 
1258 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  28.92 
 
 
1274 aa  267  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  30 
 
 
1273 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  26.08 
 
 
1246 aa  218  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  25.65 
 
 
1273 aa  202  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  24.09 
 
 
1278 aa  196  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  33.71 
 
 
1308 aa  194  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.82 
 
 
1247 aa  184  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  24.36 
 
 
1247 aa  184  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  31.5 
 
 
1239 aa  181  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24.79 
 
 
1230 aa  164  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  23.79 
 
 
1234 aa  147  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  24.08 
 
 
1238 aa  144  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25.85 
 
 
1146 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  32.63 
 
 
1146 aa  104  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.5 
 
 
1077 aa  95.9  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  26.47 
 
 
1275 aa  94.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  30.9 
 
 
1186 aa  92.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  27.7 
 
 
1210 aa  78.2  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  26.63 
 
 
1174 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  27.98 
 
 
648 aa  59.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  28.43 
 
 
645 aa  58.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  29.9 
 
 
654 aa  57  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  26.07 
 
 
656 aa  55.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  29.8 
 
 
1175 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  29.95 
 
 
1179 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  30.69 
 
 
1175 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  41.96 
 
 
619 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.96 
 
 
655 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  31.65 
 
 
999 aa  50.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  23.66 
 
 
427 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>