35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1785 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  908    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  22.73 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.85 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  32.46 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  31.06 
 
 		 1278 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  35.07 
 
 		 660 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  35.07 
 
 		 660 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1095 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  29.19 
 
 		 646 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  23.61 
 
 		 656 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.18 
 
 		 643 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1080 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1234 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  23.9 
 
 		 893 aa  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  27.75 
 
 		 789 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  30.65 
 
 		 701 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  26.11 
 
 		 911 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  28.66 
 
 		 812 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  35.24 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.02 
 
 		 732 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1247 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  32.79 
 
 		 675 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  19.32 
 
 		 712 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  22.33 
 
 		 654 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.88 
 
 		 750 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  21.95 
 
 		 648 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.82 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  23.6 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1247 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  30.39 
 
 		 1273 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  30.43 
 
 		 862 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  32.52 
 
 		 1070 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1230 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.6 
 
 		 699 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>