23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0930 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  100 
 
 
911 aa  1819    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  46.96 
 
 
928 aa  848    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  27.71 
 
 
892 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  26.21 
 
 
884 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  25.84 
 
 
892 aa  291  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  24.86 
 
 
867 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.93 
 
 
1038 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  23.35 
 
 
1031 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  23.4 
 
 
931 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  23.08 
 
 
919 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  20.69 
 
 
939 aa  111  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  19.71 
 
 
1027 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  19.04 
 
 
806 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  22.77 
 
 
1031 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  20 
 
 
1090 aa  88.2  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  22.47 
 
 
791 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  23.47 
 
 
1075 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  18.12 
 
 
812 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  17.75 
 
 
802 aa  50.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  26.11 
 
 
470 aa  47.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  23.81 
 
 
809 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  27.5 
 
 
1278 aa  45.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.76 
 
 
789 aa  44.7  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>