23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1716 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  44.09 
 
 		 884 aa  677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  100 
 
 		 867 aa  1703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  49.47 
 
 		 892 aa  813    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  30.59 
 
 		 892 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  24.36 
 
 		 911 aa  294  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  22.5 
 
 		 928 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  31.28 
 
 		 1038 aa  207  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  25.49 
 
 		 1031 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  27.19 
 
 		 919 aa  142  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  26.93 
 
 		 939 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  23.28 
 
 		 931 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1027 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  24.6 
 
 		 1031 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  26.13 
 
 		 1090 aa  121  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  22.06 
 
 		 806 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  21.08 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  19.84 
 
 		 802 aa  56.6  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  23.14 
 
 		 878 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1824  AsmA  23.93 
 
 		 879 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  25.11 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  24.2 
 
 		 665 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  21.6 
 
 		 809 aa  46.2  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1075 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>