22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1214 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  46.96 
 
 		 911 aa  832    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1850    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  26.48 
 
 		 892 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  24.83 
 
 		 884 aa  296  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  22.5 
 
 		 867 aa  270  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  22.35 
 
 		 892 aa  260  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.91 
 
 		 1038 aa  161  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  21.71 
 
 		 1031 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  23.58 
 
 		 939 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  23.66 
 
 		 931 aa  128  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  20.93 
 
 		 919 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.1 
 
 		 806 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1027 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  20.52 
 
 		 1031 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  19.88 
 
 		 1090 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  20.05 
 
 		 832 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  18.26 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  25.18 
 
 		 954 aa  48.5  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1261 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  20.32 
 
 		 1075 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24 
 
 		 1230 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  21.3 
 
 		 732 aa  45.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>