22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4317 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  42.53 
 
 		 931 aa  801    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  100 
 
 		 939 aa  1894    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  46.05 
 
 		 919 aa  842    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  36.92 
 
 		 1031 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1027 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  25.14 
 
 		 1038 aa  302  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  31.03 
 
 		 1090 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  26.68 
 
 		 1031 aa  251  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  26.96 
 
 		 892 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  27.16 
 
 		 884 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  24.59 
 
 		 892 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  26.93 
 
 		 867 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  23.58 
 
 		 928 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  20.69 
 
 		 911 aa  111  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  26.4 
 
 		 587 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.6 
 
 		 699 aa  55.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.59 
 
 		 806 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.42 
 
 		 646 aa  52  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  26.25 
 
 		 614 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  22.79 
 
 		 820 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25 
 
 		 640 aa  47.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.97 
 
 		 732 aa  46.6  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>