21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1486 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  44.44 
 
 		 1031 aa  900    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 1027 aa  2074    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  31.29 
 
 		 1090 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  37.54 
 
 		 931 aa  465  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  41.74 
 
 		 919 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  26.21 
 
 		 1031 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  36.07 
 
 		 939 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  24.47 
 
 		 1038 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  28.2 
 
 		 884 aa  162  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  25.93 
 
 		 892 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  25 
 
 		 867 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  21.6 
 
 		 928 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  20.47 
 
 		 892 aa  110  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  19.71 
 
 		 911 aa  110  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  27.61 
 
 		 587 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  18.09 
 
 		 806 aa  55.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  27.19 
 
 		 606 aa  49.7  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.12 
 
 		 695 aa  46.2  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  26.5 
 
 		 632 aa  45.8  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  27.13 
 
 		 614 aa  45.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  21.05 
 
 		 812 aa  44.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>