23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1832 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  100 
 
 		 1031 aa  2104    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  25.85 
 
 		 1031 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1027 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  23.88 
 
 		 1090 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  27.89 
 
 		 1038 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  28.87 
 
 		 919 aa  283  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  26.68 
 
 		 939 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  25.2 
 
 		 931 aa  236  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  28.67 
 
 		 884 aa  174  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  25.77 
 
 		 892 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  25.49 
 
 		 867 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  22.44 
 
 		 892 aa  144  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  21.71 
 
 		 928 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  22.8 
 
 		 911 aa  127  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.55 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  18.62 
 
 		 1075 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25 
 
 		 677 aa  48.5  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.13 
 
 		 745 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20.33 
 
 		 640 aa  45.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  23.53 
 
 		 1079 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  22.3 
 
 		 812 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  20.21 
 
 		 587 aa  45.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  21.25 
 
 		 809 aa  44.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>