119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1313 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1599    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1080 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  23.58 
 
 		 1079 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  21.96 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  24.02 
 
 		 1266 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  24.85 
 
 		 776 aa  67  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  25.65 
 
 		 699 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  27.22 
 
 		 606 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.92 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  26.33 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  22.5 
 
 		 1104 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  28.03 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  23.14 
 
 		 1260 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  25.37 
 
 		 1210 aa  65.1  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  25.87 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  24.22 
 
 		 1261 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  24.26 
 
 		 725 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  33.62 
 
 		 1061 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  27.71 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  33.68 
 
 		 1061 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.57 
 
 		 608 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.5 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1321 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1307 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1307 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1307 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1307 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1348 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  23.33 
 
 		 1208 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1318 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  29.93 
 
 		 696 aa  59.7  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1154 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  25.6 
 
 		 1151 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  24.48 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1382 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.71 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  22.7 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  26.81 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  22.01 
 
 		 1216 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1187 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1337 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.28 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.17 
 
 		 606 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  25.32 
 
 		 607 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  25.32 
 
 		 878 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.42 
 
 		 614 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1281 aa  54.7  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1824  AsmA  25.63 
 
 		 879 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  30.95 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1169 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1200 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  25.64 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  29.23 
 
 		 812 aa  52  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.2 
 
 		 607 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24 
 
 		 656 aa  52  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1189 aa  52  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  23.05 
 
 		 950 aa  52  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1268 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1032 aa  51.6  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.15 
 
 		 732 aa  51.6  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  25.99 
 
 		 611 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  25.88 
 
 		 607 aa  51.2  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1158 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  25.88 
 
 		 607 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  23.65 
 
 		 715 aa  51.2  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  27.55 
 
 		 1712 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1041 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1304 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  24.93 
 
 		 649 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  21.86 
 
 		 806 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  21.31 
 
 		 741 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1264 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1903  AsmA  26.5 
 
 		 879 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.392482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  19.95 
 
 		 892 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1264 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1095 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  26.67 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  30.46 
 
 		 712 aa  48.5  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  21.31 
 
 		 615 aa  48.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1072 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1073 aa  47.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  19.92 
 
 		 1112 aa  47.8  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1277 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  20.95 
 
 		 892 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  26.95 
 
 		 1275 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  23.14 
 
 		 1235 aa  47.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  21.56 
 
 		 1070 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1246 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  22.77 
 
 		 767 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  21.6 
 
 		 867 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.52 
 
 		 748 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.52 
 
 		 748 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  26.84 
 
 		 741 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  24.64 
 
 		 688 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  25.68 
 
 		 884 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>