107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0539 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  46.06 
 
 		 1187 aa  1019    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  100 
 
 		 1208 aa  2428    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  44.84 
 
 		 1200 aa  983    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  54.84 
 
 		 1189 aa  1311    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  44.75 
 
 		 1169 aa  1023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  47.78 
 
 		 1216 aa  1140    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  90.86 
 
 		 1210 aa  2160    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  31.85 
 
 		 1266 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  31.77 
 
 		 1261 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  31.52 
 
 		 1260 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1337 aa  479  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  28.98 
 
 		 1247 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1264 aa  476  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1264 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1281 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1268 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1277 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1283 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1275 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1268 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1275 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1271 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1124 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  27.93 
 
 		 1275 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1261 aa  393  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  32.29 
 
 		 1266 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  27.67 
 
 		 1235 aa  365  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  31.83 
 
 		 1065 aa  360  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1235 aa  354  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1304 aa  353  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1040 aa  353  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1298 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  29.16 
 
 		 978 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1382 aa  337  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1002 aa  336  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  29.45 
 
 		 978 aa  334  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  28.36 
 
 		 981 aa  330  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  28.59 
 
 		 960 aa  328  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1009 aa  327  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  28.79 
 
 		 978 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1364 aa  326  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  29.05 
 
 		 978 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  28.74 
 
 		 983 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1260 aa  317  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1197 aa  289  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1067 aa  288  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1072 aa  287  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1073 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  26.08 
 
 		 996 aa  281  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  29.69 
 
 		 950 aa  279  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1088 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1088 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1119 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1069 aa  271  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  25.43 
 
 		 1080 aa  271  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  27.75 
 
 		 955 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1011 aa  270  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1307 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1076 aa  269  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1307 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1307 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  37.87 
 
 		 1321 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1307 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1348 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1074 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1295 aa  268  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1318 aa  267  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1158 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1098 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1032 aa  265  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  27.38 
 
 		 957 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1087 aa  264  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1154 aa  262  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1161 aa  258  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1354 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1013 aa  253  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  27.25 
 
 		 1151 aa  252  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  26.05 
 
 		 1428 aa  251  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1024 aa  251  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  28.14 
 
 		 953 aa  251  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1128 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1041 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1135 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1181 aa  244  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1156 aa  242  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  26.96 
 
 		 1330 aa  242  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  27.23 
 
 		 968 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1016 aa  241  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1161 aa  241  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1021 aa  238  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1061 aa  235  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1169 aa  220  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  24.1 
 
 		 982 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  23.37 
 
 		 954 aa  211  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1144 aa  191  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  23.72 
 
 		 1112 aa  161  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  25.22 
 
 		 595 aa  142  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1022 aa  141  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  22.5 
 
 		 1081 aa  140  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1025 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>