23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0208 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 806 aa  1644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  21.4 
 
 		 802 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1075 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  21.25 
 
 		 791 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  21.99 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  22.82 
 
 		 832 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  20.47 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  21.24 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  20.1 
 
 		 928 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  21.66 
 
 		 884 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  20.17 
 
 		 892 aa  104  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  22.06 
 
 		 867 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  19.04 
 
 		 911 aa  94.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  19.61 
 
 		 820 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  23.09 
 
 		 1090 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  22.14 
 
 		 931 aa  72  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  20.44 
 
 		 1031 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  20.43 
 
 		 1038 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  20.55 
 
 		 1031 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  18.09 
 
 		 1027 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  20.71 
 
 		 919 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  20.09 
 
 		 939 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  21.86 
 
 		 809 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>