31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1971 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  100 
 
 		 892 aa  1798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  29.97 
 
 		 892 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  31.22 
 
 		 867 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  29.62 
 
 		 884 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  27.83 
 
 		 911 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  26.6 
 
 		 928 aa  357  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  40.05 
 
 		 1038 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  25.77 
 
 		 1031 aa  174  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  26.96 
 
 		 939 aa  171  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  26.84 
 
 		 919 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1027 aa  148  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  25.49 
 
 		 931 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.8 
 
 		 806 aa  128  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  23.41 
 
 		 1090 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  22.46 
 
 		 1031 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  19.58 
 
 		 802 aa  89  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  19.57 
 
 		 820 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1102 aa  67.8  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  24.02 
 
 		 812 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  19.22 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  19.94 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.61 
 
 		 797 aa  54.7  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.13 
 
 		 677 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  29.32 
 
 		 265 aa  48.9  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  19.02 
 
 		 809 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  26.95 
 
 		 1278 aa  47  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  21.8 
 
 		 1061 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  19.17 
 
 		 832 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  23.73 
 
 		 609 aa  45.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  25 
 
 		 1070 aa  45.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  26.71 
 
 		 1061 aa  44.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>