24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3185 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  100 
 
 		 1090 aa  2178    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  31.71 
 
 		 1031 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1027 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  31.87 
 
 		 919 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  23.67 
 
 		 1031 aa  352  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  28.53 
 
 		 931 aa  310  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  31.03 
 
 		 939 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  23.22 
 
 		 1038 aa  187  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  24.28 
 
 		 892 aa  139  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  23.97 
 
 		 892 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  25.35 
 
 		 884 aa  134  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  25.87 
 
 		 867 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  23.02 
 
 		 928 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  20.37 
 
 		 911 aa  84  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  22.83 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  22.25 
 
 		 791 aa  68.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  20.36 
 
 		 802 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  24.6 
 
 		 812 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1075 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  23.9 
 
 		 767 aa  48.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  26.85 
 
 		 820 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  27.03 
 
 		 670 aa  46.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  29.63 
 
 		 893 aa  45.8  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.11 
 
 		 812 aa  45.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>