22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2392 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 1075 aa  2202    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  25.72 
 
 		 806 aa  181  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  19.44 
 
 		 791 aa  105  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  22.08 
 
 		 802 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  23.47 
 
 		 911 aa  76.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  19.41 
 
 		 1031 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  19.85 
 
 		 892 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  24.24 
 
 		 816 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  18.87 
 
 		 1031 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  18.88 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  18.3 
 
 		 812 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  22.08 
 
 		 832 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  20.83 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  22.04 
 
 		 1090 aa  55.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  19.31 
 
 		 892 aa  54.3  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  21.84 
 
 		 820 aa  50.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  18.34 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  18.85 
 
 		 1027 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  19.6 
 
 		 919 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  24.66 
 
 		 695 aa  48.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  19.88 
 
 		 928 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  19.89 
 
 		 867 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>