23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0066 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  100 
 
 		 931 aa  1884    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  48.34 
 
 		 919 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  43.08 
 
 		 939 aa  787    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  37.54 
 
 		 1027 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  36.69 
 
 		 1031 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  24.33 
 
 		 1038 aa  318  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  28.53 
 
 		 1090 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  25.2 
 
 		 1031 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  23.31 
 
 		 892 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  23.32 
 
 		 892 aa  143  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  24.06 
 
 		 884 aa  137  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  24.02 
 
 		 911 aa  137  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  23.28 
 
 		 867 aa  130  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  23.66 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  22.14 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  20.59 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  20.24 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1317 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  22.41 
 
 		 812 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  24.44 
 
 		 820 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  20.06 
 
 		 832 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>