18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2340 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  44.3 
 
 		 820 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 812 aa  1619    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  39.71 
 
 		 816 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  25.46 
 
 		 832 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  21.56 
 
 		 806 aa  124  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  25.22 
 
 		 802 aa  91.3  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  21.28 
 
 		 791 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  19.92 
 
 		 892 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  24.02 
 
 		 892 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  23.97 
 
 		 884 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  18.53 
 
 		 1075 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  19.5 
 
 		 911 aa  55.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.47 
 
 		 797 aa  51.6  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  25.16 
 
 		 1090 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  19.06 
 
 		 867 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  22.31 
 
 		 931 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  21.76 
 
 		 919 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  22.3 
 
 		 1031 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>