14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4010 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  26.09 
 
 		 816 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  25 
 
 		 812 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  23.99 
 
 		 820 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  21.61 
 
 		 791 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  22.58 
 
 		 806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  22.71 
 
 		 802 aa  95.5  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  20.05 
 
 		 928 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1075 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  18.9 
 
 		 884 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  20.19 
 
 		 892 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  20.06 
 
 		 931 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  23.97 
 
 		 587 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  25 
 
 		 1031 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>